Создан первый в мире атлас городских микроорганизмов

"Дайте мне вашу обувь, и я скажу с точностью до 90%, из какого вы города", - заявил Кристофер Мэйсон, профессор медицинского колледжа Вейлл Корнелл в Нью-Йорке, соавтор первого в мире атласа городских микроорганизмов.

Во время исследования, проведенного международным консорциумом "Метагеномика и метадизайн метро и городских биомов" (MetaSUB), была создана карта микробиомов некоторых крупнейших городов.
Как стало известно ProfiDOM.com.ua, за три года ученые MetaSUB собрали 4728 метагеномных экземпляров из систем общественного транспорта в 60 городах и создали первый систематизированный каталог городских микробных экосистем. Они выяснили, что у каждого города свой уникальный микробный отпечаток, скорее всего, из-за разного климата и географии.
Общественный транспорт был естественным выбором для анализа микробиома городов. Общественным транспортом, например, автобусами и метро, каждый день пользуется около 1,2 млрд. человек по всему миру. Так что это одно из наиболее посещаемых мест в городской среде с богатым и разнообразным миром невидимых организмов.
Ученые идентифицировали 4246 известных особей городских микроорганизмов по их ДНК. Они также нашли 10928 вирусов и 1302 бактерии, пока еще неизвестных науке. Более того, был обнаружен "основной" набор из 31 особи, которых нет в организме человека, но которые были замечены в 97% всех образцов.
По словам исследователей, "постоянно обновляемый микробный атлас мира может помочь врачам, отделам здравоохранения, чиновникам и ученым в отслеживании, диагностировании и предупреждении возникновения эпидемиологических рисков и тенденций". Ученые считают, что исследование может помочь отслеживать распространение инфекционных организмов в городской среде и станет ценным ресурсом для антимикробного лечения.
По информации ProfiDOM.com.ua, у исследования было одно весомое ограничение - изучалась только ДНК. В будущих проектах будет задействована рибонуклеиновая кислота, генетический материал многих вирусов, включая SARS-CoV-2, вызывающего COVID-19.
Общественный транспорт очень сильно пострадал от эпидемии коронавируса, так как количество пассажиров резко снизилось по всему миру. Поэтому теперь консорциум занимается изучением влияния карантина на состав микробиома городов.